1 změnil soubory, kde provedl 1 přidání a 1 odebrání
+ 1
- 1
tasks/TNseq.wdl
Zobrazit soubor
| ${SENTIEON_INSTALL_DIR}/bin/sentieon driver -t $nt -r ${ref_dir}/${fasta} \ | ${SENTIEON_INSTALL_DIR}/bin/sentieon driver -t $nt -r ${ref_dir}/${fasta} \ | ||||
| $INPUT $INTERVAL \ | $INPUT $INTERVAL \ | ||||
| --algo TNhaplotyper2 $SAMPLE\ | |||||
| --algo TNhaplotyper2 $SAMPLE \ | |||||
| --germline_vcf ${germline_resource} \ | --germline_vcf ${germline_resource} \ | ||||
| $PON \ | $PON \ | ||||
| ${sample}.TNseq.$typ.vcf \ | ${sample}.TNseq.$typ.vcf \ |
Načítá se…