Procházet zdrojové kódy

Fixbug: output of annovar

tags/v0.1.3
YaqingLiu před 4 roky
rodič
revize
a2064698dc
1 změnil soubory, kde provedl 2 přidání a 3 odebrání
  1. +2
    -3
      tasks/annovar.wdl

+ 2
- 3
tasks/annovar.wdl Zobrazit soubor

task annovar { task annovar {


String sample
File vcf File vcf
String annotated_vcf = basename(vcf,".vcf") String annotated_vcf = basename(vcf,".vcf")
String hg String hg


output { output {
File avinput = "${annotated_vcf}.avinput" File avinput = "${annotated_vcf}.avinput"
File multianno_txt = "${annotated_vcf}.multianno.txt"
File multianno = "${annotated_vcf}.multianno.vcf"
File multianno_txt = "${annotated_vcf}.${hg}_multianno.txt"
File multianno = "${annotated_vcf}.${hg}_multianno.vcf"
} }
} }

Načítá se…
Zrušit
Uložit