Se han modificado 2 ficheros con 2 adiciones y 3 borrados
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defaults
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| @@ -40,6 +40,6 @@ | |||
| "annovar": false, | |||
| "vep": false, | |||
| "only_pass": true, | |||
| "input_fastq": true, | |||
| "input_fastq": false, | |||
| "input_bam": false | |||
| } | |||
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workflow.wdl
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| @@ -435,8 +435,7 @@ workflow {{ project_name }} { | |||
| } | |||
| } | |||
| } | |||
| if (input_bam) { | |||
| if (tumor_deduped_bam != "") { | |||
| call BQSR.BQSR as tumor_BQSR_fb { | |||
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