選択できるのは25トピックまでです。 トピックは、先頭が英数字で、英数字とダッシュ('-')を使用した35文字以内のものにしてください。
LUYAO REN 740dc598e1 first commit 5年前
codescripts first commit 5年前
pictures first commit 5年前
tasks first commit 5年前
LCL5.tsv first commit 5年前
README.md first commit 5年前
family.tsv first commit 5年前
inputs first commit 5年前
workflow.wdl first commit 5年前

README.md

高置信位点整合Part2——从VCF和BAM文件中提取突变位点的信息

Author: Run Luyao

E-mail:18110700050@fudan.edu.cn

Git: http://choppy.3steps.cn/renluyao/HCC_Extract_Info.git

Last Updates: 11/9/2019

安装指南

# 激活choppy环境
source activate choppy
# 安装app
choppy install renluyao/HCC_Extract_Info

App概述

当我们拿到测序结果的时候,没有办法判断哪些是真的突变位点,哪些是假阳性

流程与参数

两个问题:

  1. MNP
  2. merge之后的pos相同,但是ref和alt不同

是不是gatk的问题,尝试用bcftools norm

App输入变量与输入文件

App输出文件

结果展示与解读

CHANGELOG

FAQ