Du kan inte välja fler än 25 ämnen Ämnen måste starta med en bokstav eller siffra, kan innehålla bindestreck ('-') och vara max 35 tecken långa.

570B

Strelka2

You don’t need to tune the parameters of strelka. It bases on trained models, you may train new models to improve performance.

Two steps:

  1. Generate the configuration
   
  1. Run Strelka
   
Per sample run time

4h30min

Reference
  1. Strelka User Guide https://github.com/Illumina/strelka/blob/v2.9.x/docs/userGuide/README.md
  2. Strelka paper https://www.nature.com/articles/s41592-018-0051-x