LUYAO REN před 5 roky
rodič
revize
c2a8f0476b
1 změnil soubory, kde provedl 5 přidání a 3 odebrání
  1. +5
    -3
      README.md

+ 5
- 3
README.md Zobrazit soubor

@@ -31,9 +31,11 @@ choppy install renluyao/DELLY_somatic

2. DELLY检测突变

delly call -g <fastq_file> -o <output_bcf> -x human.hg38.excl.tsv <tumor_bam> <normal_bam>
delly filter -f somatic -o <output_filtered_bcf> -s samples.tsv <output_bcf>
```bash
delly call -g <fastq_file> -o <output_bcf> -x human.hg38.excl.tsv <tumor_bam> <normal_bam>

delly filter -f somatic -o <output_filtered_bcf> -s samples.tsv <output_bcf>
```
其中samples.tsv按照如下准备,其中的tumor_name和normal_name要与bam文件中一致

```bash

Načítá se…
Zrušit
Uložit