LUYAO REN преди 5 години
родител
ревизия
c2a8f0476b
променени са 1 файла, в които са добавени 5 реда и са изтрити 3 реда
  1. +5
    -3
      README.md

+ 5
- 3
README.md Целия файл

@@ -31,9 +31,11 @@ choppy install renluyao/DELLY_somatic

2. DELLY检测突变

delly call -g <fastq_file> -o <output_bcf> -x human.hg38.excl.tsv <tumor_bam> <normal_bam>
delly filter -f somatic -o <output_filtered_bcf> -s samples.tsv <output_bcf>
```bash
delly call -g <fastq_file> -o <output_bcf> -x human.hg38.excl.tsv <tumor_bam> <normal_bam>

delly filter -f somatic -o <output_filtered_bcf> -s samples.tsv <output_bcf>
```
其中samples.tsv按照如下准备,其中的tumor_name和normal_name要与bam文件中一致

```bash

Loading…
Отказ
Запис