更新 'tasks/BQSR.wdl' · 9a51368c82 - Choppy for Reproducible Omics Pipeline

更新 'tasks/BQSR.wdl'

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															        sentieon driver -t $nt \
															
															        sentieon driver -t $nt \
														
															        -r ${ref_dir}/${ref_fasta} -i ${deduped_bam} \
															
															        -r ${ref_dir}/${ref_fasta} -i ${deduped_bam} \
														
															        $INTERVAL \
															
															        --algo QualCal \
															
															        --algo QualCal \
														
															        -k ${dbsnp_dir}/${dbsnp} -k ${dbmills_dir}/${db_mills} \
															
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															        ${sample_id}_recal_data.table
															
															        ${sample_id}_recal_data.table