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更新 'tasks/BQSR.wdl'
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meng
2 anni fa
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81de4fac51
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9a51368c82
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tasks/BQSR.wdl
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tasks/BQSR.wdl
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@@ -31,7 +31,6 @@ task Sentieon_BQSR{
sentieon driver -t $nt \
-r ${ref_dir}/${ref_fasta} -i ${deduped_bam} \
$INTERVAL \
--algo QualCal \
-k ${dbsnp_dir}/${dbsnp} -k ${dbmills_dir}/${db_mills} \
${sample_id}_recal_data.table
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