浏览代码

更新 'tasks/TNseq.wdl'

master
meng 2 年前
父节点
当前提交
518e15366e
共有 1 个文件被更改,包括 2 次插入2 次删除
  1. +2
    -2
      tasks/TNseq.wdl

+ 2
- 2
tasks/TNseq.wdl 查看文件



if [${regions}]; then if [${regions}]; then
INTERVAL="--interval ${regions} --interval_padding ${interval_padding}" INTERVAL="--interval ${regions} --interval_padding ${interval_padding}"
else:
else
INTERVAL="" INTERVAL=""
fi fi


if [${normal_bam}];then if [${normal_bam}];then
INPUT="-i ${tumor_bam} -i ${normal_bam}" INPUT="-i ${tumor_bam} -i ${normal_bam}"
SAMPLE="--tumor_sample ${tumor_name} --normal_sample ${normal_name}" SAMPLE="--tumor_sample ${tumor_name} --normal_sample ${normal_name}"
else:
else
INPUT="-i ${tumor_bam}" INPUT="-i ${tumor_bam}"
SAMPLE="--tumor_sample ${tumor_name}" SAMPLE="--tumor_sample ${tumor_name}"
fi fi

正在加载...
取消
保存