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更新 'tasks/TNseq.wdl'

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meng vor 2 Jahren
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518e15366e
1 geänderte Dateien mit 2 neuen und 2 gelöschten Zeilen
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      tasks/TNseq.wdl

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tasks/TNseq.wdl Datei anzeigen

@@ -29,14 +29,14 @@ task sentieon_TNseq{

if [${regions}]; then
INTERVAL="--interval ${regions} --interval_padding ${interval_padding}"
else:
else
INTERVAL=""
fi

if [${normal_bam}];then
INPUT="-i ${tumor_bam} -i ${normal_bam}"
SAMPLE="--tumor_sample ${tumor_name} --normal_sample ${normal_name}"
else:
else
INPUT="-i ${tumor_bam}"
SAMPLE="--tumor_sample ${tumor_name}"
fi

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