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更新 'workflow.wdl'

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      workflow.wdl

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workflow.wdl ファイルの表示

@@ -45,7 +45,7 @@ workflow {{ project_name }} {
String docker_bcftools
String docker_annovar
String docker_tmb
String docker_tmb_MSIsensor
String docker_MSIsensor

#config
String cluster_config
@@ -108,7 +108,7 @@ call MSIsensor.MSIsensor as MSIsensor {
tumor_bam=Sentieon_BQSR_tumor.recaled_bam,
tumor_bam_index=Sentieon_BQSR_tumor.recaled_bam_index,
baseline=baseline,
docker=docker_msisensor,
docker=docker_MSIsensor,
cluster_config=cluster_config,
disk_size=disk_size
}

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