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更新 'tasks/strelka.wdl'

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@@ -5,6 +5,7 @@ task strelka_calling{
File normal_bam_bai
String ref_fasta
File ref_dir
String ref_bed
String sample_id
File? manta_indel_vcf
File? manta_indel_vcf_index
@@ -22,6 +23,7 @@ task strelka_calling{
--normalBam ${normal_bam} \
--tumorBam ${tumor_bam} \
--referenceFasta ${ref_dir}/${ref_fasta} \
--callRegions ${ref_dir}/${ref_bed} \
--runDir ${out_dir}
ls ${out_dir}

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