Bläddra i källkod

更新 'tasks/TNscope.wdl'

master
meng 2 år sedan
förälder
incheckning
0e6e1dad2c
1 ändrade filer med 2 tillägg och 1 borttagningar
  1. +2
    -1
      tasks/TNscope.wdl

+ 2
- 1
tasks/TNscope.wdl Visa fil

@@ -31,10 +31,11 @@ task sentieon_TNscope{
-i ${tumor_bam} -q ${tumor_recall_data} \
-i ${normal_bam} -q ${normal_recall_data} \
--algo TNscope --tumor_sample ${tumor_name} --normal_sample ${normal_name} \
--disable_detector sv --trim_soft_clip \
--trim_soft_clip \
--dbsnp ${dbsnp_dir}/${dbsnp} ${sample_id}.TNscope.vcf || { echo "TNscope failed"; exit 1; }
ls ./
#--disable_detector sv

>>>


Laddar…
Avbryt
Spara