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workflow.wdl
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| @@ -12,7 +12,7 @@ workflow {{ project_name }} { | |||
| call hisat2.hisat2 as hisat2 { | |||
| input: idx=idx, idx_prefix=idx_prefix, read_1P=read1, read_2P=read2 | |||
| input: idx=idx, idx_prefix=idx_prefix, read1=read1, read2=read2 | |||
| } | |||
| call samtools.samtools as samtools { | |||
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