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更新 'tasks/samtools.wdl'

sort -m 1000000000
内存更改
master
lizhihui hace 6 años
padre
commit
87e85c828e
Se han modificado 1 ficheros con 1 adiciones y 1 borrados
  1. +1
    -1
      tasks/samtools.wdl

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tasks/samtools.wdl Ver fichero

@@ -11,7 +11,7 @@ task samtools {
set -o pipefail
set -e
/opt/conda/bin/samtools view -bS ${sam} > ${bam}
/opt/conda/bin/samtools sort -m 500000000 ${bam} -o ${sorted_bam}
/opt/conda/bin/samtools sort -m 1000000000 ${bam} -o ${sorted_bam}
/opt/conda/bin/samtools index ${sorted_bam}
>>>


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