stead99
|
8ceecb10b7
|
change GENE_ID to gene_id in ballgown task
|
4 vuotta sitten |
stead99
|
3353d39878
|
modify the regular expression for obtaining sample ID
|
4 vuotta sitten |
stead99
|
c689d5ce75
|
delete sample_id in count module
|
4 vuotta sitten |
stead99
|
116f6981aa
|
add gene_abundance file in count task
|
4 vuotta sitten |
stead99
|
691db991ce
|
unified output file prefix
|
4 vuotta sitten |
stead99
|
3c076d97d5
|
add sam as hisat2 output
|
4 vuotta sitten |
stead99
|
a092c433b0
|
remove hisat2 sam output and qualimap bamqc
|
4 vuotta sitten |
stead99
|
810791be91
|
revise fastq output
|
4 vuotta sitten |
YJC
|
5e8e1f7c44
|
[Fix Bug] to_json filter doesn't exist & imporve schema.
|
4 vuotta sitten |
YJC
|
09187e0cce
|
Improve indentation.
|
4 vuotta sitten |
YJC
|
c37b3ec35b
|
Improve format.
|
4 vuotta sitten |
stead99
|
9e1b95f341
|
reivse input boolean type
|
4 vuotta sitten |
stead99
|
6f018f49be
|
reivse input boolean type
|
4 vuotta sitten |
stead99
|
117da06934
|
reivse input
|
4 vuotta sitten |
stead99
|
fc4b9d7abd
|
revise readme
|
4 vuotta sitten |
stead99
|
d4a4b06431
|
Merge http://choppy.3steps.cn/junshang/rnaseq-engineering
|
4 vuotta sitten |
stead99
|
a763afd6fc
|
revise readme
|
4 vuotta sitten |
YJC
|
b1acd1de20
|
Add manifest.json & schema.json.
|
4 vuotta sitten |
stead99
|
3dcd37a58a
|
revise ballgwon output files
|
4 vuotta sitten |
stead99
|
f56829c706
|
revise readme
|
4 vuotta sitten |
stead99
|
e62f1ac977
|
revise readme
|
4 vuotta sitten |
stead99
|
35d0d89a43
|
revise readme
|
4 vuotta sitten |
stead99
|
6c7490240b
|
revise readme
|
4 vuotta sitten |
stead99
|
241ae9413a
|
remove fastp useless paramater
|
4 vuotta sitten |
stead99
|
b7bda92886
|
remove fastp useless paramater
|
4 vuotta sitten |
stead99
|
7c829c5944
|
revise samtools sort -m
|
4 vuotta sitten |
stead99
|
03e4cebb4d
|
revise samtools sort -m
|
4 vuotta sitten |
stead99
|
666f527e1e
|
revise samtools sort -m
|
4 vuotta sitten |
stead99
|
fdeace50a2
|
revise fastp
|
4 vuotta sitten |
stead99
|
794cad5116
|
revise fastp
|
4 vuotta sitten |
stead99
|
0dcb8a5927
|
revise fastp
|
4 vuotta sitten |
stead99
|
b09971694e
|
revise fastp
|
4 vuotta sitten |
stead99
|
46cfcdba8e
|
revise fastp
|
4 vuotta sitten |
stead99
|
1c22f7c059
|
revise fastqc output
|
4 vuotta sitten |
stead99
|
0980cf357b
|
nt to $nt
|
4 vuotta sitten |
stead99
|
b0a99f4bd6
|
revise workflow
|
4 vuotta sitten |
stead99
|
f2ad8a81f3
|
revise workflow
|
4 vuotta sitten |
stead99
|
6c72014d22
|
revise workflow
|
4 vuotta sitten |
stead99
|
44f973992b
|
revise inputs
|
4 vuotta sitten |
stead99
|
e34189329d
|
revise inputs
|
4 vuotta sitten |
stead99
|
9ab997b8fd
|
add fastp and revise samtools thread
|
4 vuotta sitten |
stead99
|
e4e128e747
|
revise samtools output
|
4 vuotta sitten |
stead99
|
2e5b254968
|
revise samtools output
|
4 vuotta sitten |
stead99
|
8dccd3f05f
|
revise samtools output
|
4 vuotta sitten |
stead99
|
3378a0afda
|
revise samtools output
|
4 vuotta sitten |
stead99
|
fa79e25c0b
|
revise samtools output
|
4 vuotta sitten |
stead99
|
737260cb9b
|
revise samtools output
|
4 vuotta sitten |
stead99
|
44b478462c
|
revise samtools output
|
4 vuotta sitten |
stead99
|
e14cb27a43
|
revise samtools output
|
4 vuotta sitten |
stead99
|
a8bf10f3f0
|
revise samtools output
|
4 vuotta sitten |