Bladeren bron

revise samtools output

tags/v0.1.0
stead99 4 jaren geleden
bovenliggende
commit
a8bf10f3f0
1 gewijzigde bestanden met toevoegingen van 2 en 3 verwijderingen
  1. +2
    -3
      tasks/samtools.wdl

+ 2
- 3
tasks/samtools.wdl Bestand weergeven

@@ -2,9 +2,8 @@ task samtools {
File sam
String base=basename(sam, ".sam")
String bam=base + ".bam"
String out_unsort_bam=base + ".bam"
String out_sort_bam=base + ".sorted.bam"
String out_sort_bam_index=base + ".sorted.bam.bai"
String sorted_bam=base + ".sorted.bam"
String sorted_bam_index=base + ".sorted.bam.bai"
String samstats=base + ".samstats"
String docker
String cluster

Laden…
Annuleren
Opslaan