更新 'tasks/rmats.wdl'

tasks/rmats.wdl

@@ -3,6 +3,7 @@ task rmats {
     File bam1
     File bam2
     File reference_gtf_file
+    String CSTAT
     
 
     String docker
@@ -27,6 +28,7 @@ task rmats {
             -t paired \
             --readLength 150 \
             --nthread 4 \
+            --cstat ${CSTAT}
             --od ${sample_id}/output \
             --tmp ${sample_id}/tmp_output