Integrate the graphs across samples, to form one merged splicing graph (per gene).
Você não pode selecionar mais de 25 tópicos Os tópicos devem começar com uma letra ou um número, podem incluir traços ('-') e podem ter até 35 caracteres.

workflow.wdl 516B

3 anos atrás
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  1. import "./tasks/spladder_merge.wdl" as spladder_merge
  2. workflow {{ project_name }} {
  3. String sample_id
  4. File bam
  5. File pickle
  6. File reference_gtf_file
  7. File samples
  8. String spladder_docker
  9. String spladder_cluster
  10. String disk_size
  11. call spladder_merge.spladder_merge as spladder_merge {
  12. input:
  13. reference_gtf_file=reference_gtf_file,
  14. sample_id=sample_id,
  15. bam=bam,
  16. pickle=pickle,
  17. samples=samples,
  18. docker=spladder_docker,
  19. cluster=spladder_cluster,
  20. disk_size=disk_size
  21. }
  22. }