Integrate the graphs across samples, to form one merged splicing graph (per gene).
Nie możesz wybrać więcej, niż 25 tematów Tematy muszą się zaczynać od litery lub cyfry, mogą zawierać myślniki ('-') i mogą mieć do 35 znaków.

workflow.wdl 516B

3 lat temu
3 lat temu
3 lat temu
3 lat temu
3 lat temu
1234567891011121314151617181920212223242526
  1. import "./tasks/spladder_merge.wdl" as spladder_merge
  2. workflow {{ project_name }} {
  3. String sample_id
  4. File bam
  5. File pickle
  6. File reference_gtf_file
  7. File samples
  8. String spladder_docker
  9. String spladder_cluster
  10. String disk_size
  11. call spladder_merge.spladder_merge as spladder_merge {
  12. input:
  13. reference_gtf_file=reference_gtf_file,
  14. sample_id=sample_id,
  15. bam=bam,
  16. pickle=pickle,
  17. samples=samples,
  18. docker=spladder_docker,
  19. cluster=spladder_cluster,
  20. disk_size=disk_size
  21. }
  22. }