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更新 'tasks/spladder_merge.wdl'

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@@ -16,9 +16,9 @@ task spladder_merge {

mkdir -p ${sample_id}/spladder_out/spladder
ln -s ${bam}/*.bam$ ./
ln -s ${bam}/*.bam ./
ls ./ | grep bam$ > alignment.txt
ln -s ${bam}/*.bai$ ./
ln -s ${bam}/*.bai ./
ls ./ | grep bai$ > alignment_bai.txt
ln -s ${pickle}/*.pickle ${sample_id}/spladder_out/spladder/
ls ${sample_id}/spladder_out/spladder/ >> pickle.txt

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