Преглед на файлове

更新 'tasks/spladder_merge.wdl'

master
chenqingwang преди 3 години
родител
ревизия
2efdb3ae82
променени са 1 файла, в които са добавени 2 реда и са изтрити 2 реда
  1. +2
    -2
      tasks/spladder_merge.wdl

+ 2
- 2
tasks/spladder_merge.wdl Целия файл

@@ -16,9 +16,9 @@ task spladder_merge {

mkdir -p ${sample_id}/spladder_out/spladder
ln -s ${bam}/*.bam$ ./
ln -s ${bam}/*.bam ./
ls ./ | grep bam$ > alignment.txt
ln -s ${bam}/*.bai$ ./
ln -s ${bam}/*.bai ./
ls ./ | grep bai$ > alignment_bai.txt
ln -s ${pickle}/*.pickle ${sample_id}/spladder_out/spladder/
ls ${sample_id}/spladder_out/spladder/ >> pickle.txt

Loading…
Отказ
Запис