Переглянути джерело

更新 'tasks/battenberg.wdl'

/opt/conda/envs/samtools/bin/samtools
master
biochenglinliu 1 рік тому
джерело
коміт
8239d3d616
1 змінених файлів з 1 додано та 1 видалено
  1. +1
    -1
      tasks/battenberg.wdl

+ 1
- 1
tasks/battenberg.wdl Переглянути файл

@@ -15,7 +15,7 @@ task battenberg {
cp ${normal_bam} ./${normal_id}.bam
cp ${tumor_bam} ./${sample_id}.bam

/opt/conda/envs/batternberg/bin/samtools view -h -@ 16 -o ${normal_id}.sorted.deduped.sam ./${normal_id}.bam
/opt/conda/envs/samtools/bin/samtools view -h -@ 16 -o ${normal_id}.sorted.deduped.sam ./${normal_id}.bam

>>>


Завантаження…
Відмінити
Зберегти