Просмотр исходного кода

Fixbug: output of annovar

tags/v0.1.3
YaqingLiu 4 лет назад
Родитель
Сommit
a2064698dc
1 измененных файлов: 2 добавлений и 3 удалений
  1. +2
    -3
      tasks/annovar.wdl

+ 2
- 3
tasks/annovar.wdl Просмотреть файл

@@ -1,6 +1,5 @@
task annovar {

String sample
File vcf
String annotated_vcf = basename(vcf,".vcf")
String hg
@@ -26,7 +25,7 @@ task annovar {

output {
File avinput = "${annotated_vcf}.avinput"
File multianno_txt = "${annotated_vcf}.multianno.txt"
File multianno = "${annotated_vcf}.multianno.vcf"
File multianno_txt = "${annotated_vcf}.${hg}_multianno.txt"
File multianno = "${annotated_vcf}.${hg}_multianno.vcf"
}
}

Загрузка…
Отмена
Сохранить