променени са 1 файла, в които са добавени 2 реда и са изтрити 1 реда
+ 2
- 1
tasks/bcftools1.wdl
Целия файл
| @@ -12,7 +12,8 @@ task bcftools { | |||
| set -e | |||
| if [ ${PONmode} ]; then | |||
| bcftools view ${bcfpon} -Oz -o $(basename ${bcfpon}.gz) | |||
| name=$(basename ${bcfpon}) | |||
| bcftools view ${bcfpon} -Oz -o ${name}.gz | |||
| else | |||
| echo 1 | |||
| fi | |||
Loading…