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YaqingLiu 5 년 전
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5cfd00e3eb
1개의 변경된 파일7개의 추가작업 그리고 6개의 파일을 삭제
  1. +7
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      tasks/bamdst.wdl

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tasks/bamdst.wdl 파일 보기

@@ -12,13 +12,14 @@ task bamdst {
set -o pipefail
set -e
nt=$(nproc)
bamdst -p ${bed} -o ./ ${bam}
cp ./chromosomes.report ./${sample}_chromosomes.report
cp ./coverage.report ./${sample}_coverage.report
cp ./depth_distribution.plot ./${sample}_depth_distribution.plot
cp ./insertsize.plot ./${sample}_insertsize.plot
cp ./region.tsv.gz ./${sample}_region.tsv.gz
cp ./uncover.bed ./${sample}_uncover.bed
cp chromosomes.report ${sample}_chromosomes.report
cp coverage.report ${sample}_coverage.report
cp depth_distribution.plot ${sample}_depth_distribution.plot
cp insertsize.plot ${sample}_insertsize.plot
cp region.tsv.gz ${sample}_region.tsv.gz
cp uncover.bed ${sample}_uncover.bed
>>>

runtime {

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