Просмотр исходного кода

Fix bug: processSomatic input

master
YaqingLiu 4 лет назад
Родитель
Сommit
24e8a2aa77
1 измененных файлов: 2 добавлений и 2 удалений
  1. +2
    -2
      tasks/processSomatic.wdl

+ 2
- 2
tasks/processSomatic.wdl Просмотреть файл

File ref_dir File ref_dir
String fasta String fasta
String varscan_docker
String docker
String cluster_config String cluster_config
String disk_size String disk_size


java -Xmx12g -jar /opt/VarScan.v2.4.3.jar processSomatic ${varscan_snp} java -Xmx12g -jar /opt/VarScan.v2.4.3.jar processSomatic ${varscan_snp}
java -Xmx12g -jar /opt/VarScan.v2.4.3.jar processSomatic ${varscan_indel} java -Xmx12g -jar /opt/VarScan.v2.4.3.jar processSomatic ${varscan_indel}
>>> >>>
runtime { runtime {
docker: docker docker: docker
cluster: cluster_config cluster: cluster_config

Загрузка…
Отмена
Сохранить