Bladeren bron

Fix bug: processSomatic input

master
YaqingLiu 4 jaren geleden
bovenliggende
commit
24e8a2aa77
1 gewijzigde bestanden met toevoegingen van 2 en 2 verwijderingen
  1. +2
    -2
      tasks/processSomatic.wdl

+ 2
- 2
tasks/processSomatic.wdl Bestand weergeven

@@ -6,7 +6,7 @@ task processSomatic {
File ref_dir
String fasta
String varscan_docker
String docker
String cluster_config
String disk_size

@@ -14,7 +14,7 @@ task processSomatic {
java -Xmx12g -jar /opt/VarScan.v2.4.3.jar processSomatic ${varscan_snp}
java -Xmx12g -jar /opt/VarScan.v2.4.3.jar processSomatic ${varscan_indel}
>>>
runtime {
docker: docker
cluster: cluster_config

Laden…
Annuleren
Opslaan