Переглянути джерело

Fix bug: Sibling nodes have conflicting names

master
YaqingLiu 4 роки тому
джерело
коміт
0e23016180
1 змінених файлів з 4 додано та 4 видалено
  1. +4
    -4
      tasks/vcf2maf.wdl

+ 4
- 4
tasks/vcf2maf.wdl Переглянути файл



String sample String sample
File multianno_txt File multianno_txt
String maf = basename(multianno_txt,".hg38_multianno.txt")
String maf_name = basename(multianno_txt,".hg38_multianno.txt")
String docker String docker
String cluster_config String cluster_config
String disk_size String disk_size


command <<< command <<<
vcf2maf ${multianno_txt} ${maf}.maf
vcf2maf ${multianno_txt} ${maf_name}.maf
>>> >>>


runtime { runtime {
} }


output { output {
File maf = "${maf}.maf"
File maf = "${maf_name}.maf"
} }
} }

Завантаження…
Відмінити
Зберегти