Update: VEP parameter

tasks/VEP.wdl

     
     perl ${vep_path}/vep --format vcf --vcf \
     --assembly ${ncbi_build} \
+    --species ${species} \
     --everything --af_exac \
     --offline \
     --cache --dir_cache ${cache} \
     --fasta ${ref_dir}/${fasta} \
     --input_file ${basename}.PASS.vcf --output_file ${basename}.PASS.vep.vcf
 
-    
+
     # vcf2maf
     perl ${vcf2maf_path}/vcf2maf.pl \
     --inhibit-vep \