YaqingLiu
/
PoN
Vērot 1
Pievienot zvaigznīti 0
Atdalīts 0
Kods Problēmas 0 Izmaiņu pieprasījumi 0 Laidieni 0 Vikivietne Aktivitāte
Generate the Panel of Normal files for TNseq and TNscope.
Nevar pievienot vairāk kā 25 tēmas Tēmai ir jāsākas ar burtu vai ciparu, tā var saturēt domu zīmes ('-') un var būt līdz 35 simboliem gara.
20 Revīzijas
1 Atzars
Koks: f9a394ceb8
Atzari Tagi
${ item.name }
Izveidot atzaru ${ searchTerm }
no 'f9a394ceb8'
${ noResults }
YaqingLiu f9a394ceb8 indent using 2 spaces pirms 4 gadiem
tasks indent using 2 spaces pirms 4 gadiem
.DS_Store Alter: test pirms 4 gadiem
README.md Add: mergePoN pirms 4 gadiem
defaults indent using 2 spaces pirms 4 gadiem
inputs Alter: add bcftools_docker pirms 4 gadiem
workflow.wdl add realigner and bqsr pirms 4 gadiem

README.md

README.md

Author: Yaqing Liu

Email: yaqing.liu@outlook.com

Last Updates: 07/04/2021

Requirements

  • choppy
  • Ali-Cloud
  • Linux

Panel of Normals

The Panel of Normals approach uses a set of matched normal samples to determine the baseline level from which to call CNV events. These matched normal samples should be derived from the same library prep and sequencing workflow that was used for the case sample. This allows the algorithm to subtract out system level biases that are not sample specific.

Usage

```