YaqingLiu 4 лет назад
Родитель
Сommit
45a0f764e7
2 измененных файлов: 3 добавлений и 3 удалений
  1. +1
    -1
      inputs
  2. +2
    -2
      workflow.wdl

+ 1
- 1
inputs Просмотреть файл

@@ -1,5 +1,5 @@
{
"{{ project_name }}.sample_id": "{{ sample_id }}",
"{{ project_name }}.panel_id": "{{ panel_id }}",
"{{ project_name }}.normal_recaled_bam_bai": "{{ normal_recaled_bam_bai | tojson }}",
"{{ project_name }}.fasta": "{{ fasta }}",
"{{ project_name }}.ref_dir": "{{ ref_dir }}",

+ 2
- 2
workflow.wdl Просмотреть файл

@@ -4,7 +4,7 @@ import "./tasks/mergePoN.wdl" as mergePoN
workflow {{ project_name }} {
String SENTIEON_INSTALL_DIR
String SENTIEON_LICENSE
String sample_id
String panel_id

File ref_dir
String fasta
@@ -61,7 +61,7 @@ workflow {{ project_name }} {
disk_size=disk_size,
cluster_config=cluster_config
}
call mergePoN.mergePoN as mergePoN_TNscope {
input:
pon_vcfs=TNscope_pon_vcfs,

Загрузка…
Отмена
Сохранить