共有 2 个文件被更改，包括 2 次插入 和 2 次删除
二进制
.DS_Store
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+ 2
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tasks/vaf_ncm.wdl
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| command <<< | command <<< | ||||
| set -o pipefail | set -o pipefail | ||||
| set -e | set -e | ||||
| #nt=$(nproc) | |||||
| nt=$(nproc) | |||||
| export NCM_HOME=/opt/NGSCheckMate | export NCM_HOME=/opt/NGSCheckMate | ||||
| mkdir -p /ncm/fastq_vaf/ | mkdir -p /ncm/fastq_vaf/ | ||||
| cp ${sep=" " vaf} /ncm/fastq_vaf/ | cp ${sep=" " vaf} /ncm/fastq_vaf/ | ||||
| python /opt/NGSCheckMate/vaf_ncm.py -I /ncm/fastq_vaf/ -O '.' -f | |||||
| python /opt/NGSCheckMate/vaf_ncm.py -I /ncm/fastq_vaf/ -O '.' -f -p $nt | |||||
| >>> | >>> | ||||
| runtime { | runtime { |
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