YaqingLiu 4 роки тому
джерело
коміт
8761e863be
1 змінених файлів з 1 додано та 1 видалено
  1. +1
    -1
      tasks/NGScheckMates.wdl

+ 1
- 1
tasks/NGScheckMates.wdl Переглянути файл

@@ -11,7 +11,7 @@ task NGScheckMates {
set -e
nt=$(nproc)
export NCM_HOME=/opt/NGSCheckMate
python /opt/NGSCheckMate/ncm_fastq.py -l ${input_file} -pt /opt/NGSCheckMate/SNP/SNP.pt -O '.' -p $nt -f -s 0.1
python /opt/NGSCheckMate/ncm_fastq.py -l ${input_file} -pt /opt/NGSCheckMate/SNP/SNP.pt -O '.' -p $nt -f -s 0.3
# rename
mv output_all.txt ${sample_id}_output_all.txt
mv output_corr_matrix.txt ${sample_id}_output_corr_matrix.txt

Завантаження…
Відмінити
Зберегти