LUYAO REN
6 年之前
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tasks/NGScheckMates.wdl
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| set -o pipefail | set -o pipefail | ||||
| set -e | set -e | ||||
| nt=$(nproc) | nt=$(nproc) | ||||
| python /opt/NGSCheckMate/ncm_fastq.py -l ${input_file} -pt /opt/NGSCheckMate/SNP/SNP.pt -O './' -p $nt -s 0.3 -f | |||||
| python /opt/NGSCheckMate/ncm_fastq.py -l ${input_file} -pt /opt/NGSCheckMate/SNP/SNP.pt -O './' -p $nt -f | |||||
| >>> | >>> | ||||
| runtime { | runtime { |
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