LUYAO REN
6 年前
共有 2 个文件被更改，包括 3 次插入 和 2 次删除
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README.md
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| # NGS Check mates | |||||
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tasks/NGScheckMates.wdl
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| File input_file | File input_file | ||||
| File out_dir | File out_dir | ||||
| String docker | String docker | ||||
| String out_dir = "./" | |||||
| String cluster_config | String cluster_config | ||||
| String disk_size | String disk_size | ||||
| set -o pipefail | set -o pipefail | ||||
| set -e | set -e | ||||
| nt=$(nproc) | nt=$(nproc) | ||||
| python ncm_fastq.py -l ${input_file} -pt SNP/SNP.pt –O ${out_dir} -p $nt -s 0.3 -f | |||||
| python ncm_fastq.py -l ${input_file} -pt SNP/SNP.pt –O ./ -p $nt -s 0.3 -f | |||||
| >>> | >>> | ||||
| runtime { | runtime { |
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