# seg | # seg | ||||
cnvkit.py export seg *.cns -o ${sample_id}.seg | cnvkit.py export seg *.cns -o ${sample_id}.seg | ||||
# heatmap | # heatmap | ||||
cnvkit.py heatmap *.cns -o ${sample_id}.heatmap | |||||
cnvkit.py heatmap *.cns -o ${sample_id}.heatmap.pdf | |||||
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runtime { | runtime { |