2 змінених файлів з 0 додано та 3 видалено
+ 0
- 1
inputs
Переглянути файл
| @@ -1,5 +1,4 @@ | |||
| { | |||
| "{{ project_name }}.sample_id": "{{ sample_id }}", | |||
| "{{ project_name }}.vcf": "{{ vcf }}", | |||
| "{{ project_name }}.annovar_docker": "{{ annovar_docker }}", | |||
| "{{ project_name }}.database": "{{ database }}", | |||
+ 0
- 2
workflow.wdl
Переглянути файл
| @@ -2,7 +2,6 @@ import "./tasks/annovar.wdl" as annovar | |||
| workflow {{ project_name }} { | |||
| String sample_id | |||
| File vcf | |||
| File database | |||
| String annovar_docker | |||
| @@ -11,7 +10,6 @@ workflow {{ project_name }} { | |||
| call annovar.annovar as indel_loh_annovar { | |||
| input: | |||
| sample_id=sample_id, | |||
| vcf=vcf, | |||
| database=database, | |||
| docker=annovar_docker, | |||
Завантаження…