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README.md

@@ -1,6 +1,6 @@
 > Author: Yueqiang Song    
 > Email: songyq_hello@163.com     
-> Last Updates: 25/12/2020    
+> Last Updates: 15/12/2020    
 
 #### Requirements
 
@@ -8,16 +8,21 @@
 - Ali-Cloud
 
 ```
+# 激活choppy环境
 $ source activate choppy-pipe-0.3.8.dev0
+# 安装 mergefq
 $ choppy install songyueqiang/mergefq
-# 如果已安装，可加参数 -f
+# 如果已安装，可加参数 -f强制安装
 $ choppy install songyueqiang/mergefq -f
+# 查看已安装的app
 $ choppy apps
 ```
 
 #### quick start
 
 ```
+# 准备sample.csv
+$ choppy samples songyueqiang/mergefq-latest > samples.csv
 # 运行命令
 $ choppy batch songyueqiang/mergefq-latest sample.csv --project-name Your_project_name
 # 查询运行情况
@@ -27,4 +32,12 @@ $ choppy query -s ID -m
 
 ```
 
+#### 参数
+- fq1,需要merge的第一个fastq文件
+- fq2,需要merge的第二个fastq文件
+- fq3,可选参数, 需要merge的第三个fastq文件,如果没有, 在sample.csv中则为空.这里设置, 最多合并3个fastq文件
+- fq_m, merge之后的fastq文件
+- sample_id, sample id
+- disk_size,数据盘大小，单位是GB
+