LUYAO REN
4 лет назад
1 измененных файлов: 1 добавлений и 1 удалений
+ 1
- 1
tasks/merge_family.wdl
Просмотреть файл
| /opt/rtg-tools/dist/rtg-tools-3.10.1-4d58ead/rtg vcfannotate --relabel=${rename} -i ${LCL8_vcf_gz} -o LCL8.vcf.gz | /opt/rtg-tools/dist/rtg-tools-3.10.1-4d58ead/rtg vcfannotate --relabel=${rename} -i ${LCL8_vcf_gz} -o LCL8.vcf.gz | ||||
| /opt/rtg-tools/dist/rtg-tools-3.10.1-4d58ead/rtg vcfmerge --force-merge-all -o ${project}.family.vcf.gz LCL5_vcf_gz LCL6_vcf_gz LCL7_vcf_gz LCL8_vcf_gz | |||||
| /opt/rtg-tools/dist/rtg-tools-3.10.1-4d58ead/rtg vcfmerge --force-merge-all -o ${project}.family.vcf.gz LCL5.vcf.gz LCL6.vcf.gz LCL7.vcf.gz LCL8.vcf.gz | |||||
| gunzip ${project}.family.vcf.gz | gunzip ${project}.family.vcf.gz | ||||
Загрузка…