No puede seleccionar más de 25 temas Los temas deben comenzar con una letra o número, pueden incluir guiones ('-') y pueden tener hasta 35 caracteres de largo.

324B

q30

A simple script to calculate q20/q30 percentages of a fastq file (can be gzipped)

python q30.py <fastq_file_name>

output

('total bases:', 1386659)
('q20 bases:', 1280980)
('q30 bases:', 1232024)
('q20 percents:', 92.37887613320939)
('q30 percents:', 88.84837584438567)
Time used: 0.221389055252