LUYAO REN
vor 6 Jahren
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tasks/strelka.wdl
Datei anzeigen
| @@ -14,7 +14,7 @@ task strelka { | |||
| set -o pipefail | |||
| set -e | |||
| nt=$(nproc) | |||
| configureStrelkaGermlineWorkflow.py --bam ${Dedup_bam} --referenceFasta ${ref_dir}/${fasta} | |||
| /strelka-2.9.10.centos6_x86_64/bin/configureStrelkaGermlineWorkflow.py --bam ${Dedup_bam} --referenceFasta ${ref_dir}/${fasta} | |||
| StrelkaGermlineWorkflow/runWorkflow.py -m local -j $nt | |||
| >>> | |||
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