LUYAO REN
6 роки тому
1 змінених файлів з 1 додано та 1 видалено
+ 1
- 1
README.md
Переглянути файл
| # GATK3, if you are using gatk4, please pay attention to the new arguments | # GATK3, if you are using gatk4, please pay attention to the new arguments | ||||
| java -jar GenomeAnalysisTK.jar -T VariantFiltration -R hg_19.fasta -V input.vcf -window 35 -cluster 3 -filterName FS -filter "FS > 30.0" -filterName QD -filter "QD < 2.0" -o output.vcf | java -jar GenomeAnalysisTK.jar -T VariantFiltration -R hg_19.fasta -V input.vcf -window 35 -cluster 3 -filterName FS -filter "FS > 30.0" -filterName QD -filter "QD < 2.0" -o output.vcf | ||||
| ``` | ``` | ||||
| **one sample running time** | |||||
| **Per sample running time** | |||||
| Less than 4 hours | Less than 4 hours | ||||
Завантаження…