Nevar pievienot vairāk kā 25 tēmas
Tēmai ir jāsākas ar burtu vai ciparu, tā var saturēt domu zīmes ('-') un var būt līdz 35 simboliem gara.
LUYAO REN
4beee1ce96
rtg in vcfstat
|
pirms 5 gadiem | |
|---|---|---|
| pictures | pirms 5 gadiem | |
| tasks | pirms 5 gadiem | |
| README.md | pirms 5 gadiem | |
| Report.md | pirms 5 gadiem | |
| fastq_screen.conf | pirms 5 gadiem | |
| inputSamplesFileExamples.tsv | pirms 5 gadiem | |
| inputs | pirms 5 gadiem | |
| workflow.wdl | pirms 5 gadiem | |
README.md
中华家系1号标准物质室间质评报告系统分析流程
1. 中华家系1号标准物质介绍
2. 分析流程图
3. 各模块运行流程
准备inputSamplesFIle (tsv格式)
#fastq_read1 #fastq_read2 #bam #bai #vcf #sample_mark
(1) fastqc
(2) fastqscreen
(3) qualimap
(4) benchmarking (hap.py)
(5) multiqc
(6) VcfStats
注：可查询multiqc支持的指控模块，按需求添加 https://multiqc.info/docs/#multiqc-modules