室间质评
選択できるのは25トピックまでです。 トピックは、先頭が英数字で、英数字とダッシュ('-')を使用した35文字以内のものにしてください。
LUYAO REN 3d4fc9db41 output of bamqc to multiqc 5年前
pictures first commit 5年前
tasks output of bamqc to multiqc 5年前
README.md output of bamqc to multiqc 5年前
Report.md first commit 5年前
fastq_screen.conf first commit 5年前
inputSamplesFileExamples.tsv first commit 5年前
inputs output of bamqc to multiqc 5年前
workflow.wdl output of bamqc to multiqc 5年前

README.md

中华家系1号标准物质室间质评报告系统分析流程

1. 中华家系1号标准物质介绍

2. 分析流程图

3. 各模块运行流程

准备inputSamplesFIle (tsv格式)

#fastq_read1	#fastq_read2	#bam	#bai	#vcf	#sample_mark

(1) fastqc

(2) fastqscreen

(3) qualimap

(4) benchmarking (hap.py)

(5) multiqc

(6) VcfStats

注:可查询multiqc支持的指控模块,按需求添加 https://multiqc.info/docs/#multiqc-modules