更新 'tasks/BQSR.wdl' · e4dfd62b61 - Choppy for Reproducible Omics Pipeline

更新 'tasks/BQSR.wdl'

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e4dfd62b61

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															        nt=$(nproc)
															
															        nt=$(nproc)
														
															        #if [${regions}];then
															
															        #    INTERVAL="--interval ${regions} --interval_padding ${interval_padding}"
															
															        #else
															
															            INTERVAL=""
															
															        #fi
															
															        sentieon driver -t $nt \
															
															        sentieon driver -t $nt \
														
															        -r ${ref_dir}/${ref_fasta} -i ${deduped_bam} \
															
															        -r ${ref_dir}/${ref_fasta} -i ${deduped_bam} \