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meng
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wgs_somatic_pipeline_v1
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更新 'tasks/BQSR.wdl'
master
meng
2 anos atrás
pai
803a6b909f
commit
e4dfd62b61
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tasks/BQSR.wdl
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@@ -28,11 +28,6 @@ task Sentieon_BQSR{
nt=$(nproc)
#if [${regions}];then
# INTERVAL="--interval ${regions} --interval_padding ${interval_padding}"
#else
INTERVAL=""
#fi
sentieon driver -t $nt \
-r ${ref_dir}/${ref_fasta} -i ${deduped_bam} \
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