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@@ -5,8 +5,8 @@
"tumor_in2":"",
"sample_id":"",
"Seq_platform":"Illumina",
"ref_fasta":"",
"ref_fasta_dir":"",
"ref_fasta":"GRCh38.d1.vd1.fa",
"ref_fasta_dir":"oss://hcc1395/reference_genome/GRCh38.d1.vd1/",
"docker_fastp":"registry-vpc.cn-shanghai.aliyuncs.com/easygene/fastp:v0.20.1_cv1",
"docker_sentieon":"registry.cn-shanghai.aliyuncs.com/hcc1395_aliyun/sentieon-genomics:v202112.05",
"docker_qualimap":"registry.cn-shanghai.aliyuncs.com/hcc1395_aliyun/qualimap:2.0.0",
@@ -14,7 +14,7 @@
"docker_strelka":"registry.cn-shanghai.aliyuncs.com/hcc1395_aliyun/strelka:v2.9.10",
"SENTIEON_LICENSE":"172.25.2.5:8990",
"cluster_config":"OnDemand ecs.sn1ne.4xlarge img-ubuntu-vpc",
"disk_size":500,
"disk_size":"500",
"fastqc":false,
"annot_gff":"oss://hcc1395/reference_genome/gencode.v36.annotation.gff",
"dbsnp_dir":"oss://hcc1395/reference_genome/GRCh38.d1.vd1/",

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