更新 'tasks/manta.wdl'

tasks/manta.wdl

@@ -1,6 +1,6 @@
 task manta_calling{
-    File tumour_bam
-    File tumour_bam_bai
+    File tumor_bam
+    File tumor_bam_bai
     File normal_bam
     File normal_bam_bai
     String ref_fasta
@@ -18,7 +18,7 @@ task manta_calling{
     nt=$(nproc)
     /home/biosoft/manta-1.6.0.centos6_x86_64/bin/configManta.py \
     --normalBam ${normal_bam} \
-    --tumorBam ${tumour_bam} \
+    --tumorBam ${tumor_bam} \
     --referenceFasta ${ref_dir}/${ref_fasta} \
     --runDir ${out_dir}